El eeprom_clear olvídate. Es para borrar la eeprom interna del arduino, y en tu caso no sirve porque tanto el programa como el bootloader están en la flash... Lo raro es que al cargar otro programa no ...
Internet es una fuente inagotable de información y conocimiento - si sabes buscar bien y cribar - y buena muestra de ello es el movimiento DIY o Do it yourself. Porque hacerlo tú mismo no solo puede ...